Mario Niepel

Ich habe meine Doktorarbeit im Labor von Mike Rout an der Rockefeller University gemacht. Ich arbeitete an einer grundlegenden Frage der Zellbiologie und Biochemie: Was ist die Rolle von Mlp1 und Mlp2 in der Hefe? Zunächst verfolgte ich einen phänotypischen Ansatz, aber die Vielfalt der Phänotypen durch Deletion der Mlp-Proteine erwies sich als zu verwirrend für die Interpretation. Stattdessen optimierte ich einen biochemischen Ansatz, um native Komplexe aus Hefe zu isolieren und die Komponenten mittels Massenspektrometrie zu analysieren.

In Übereinstimmung mit früheren Erkenntnissen waren die dominanten Bindungspartner der Mlps Komponenten des NPC und der mRNA-Verarbeitungs- und Transportmaschinerie. Ich identifizierte jedoch auch eine große Anzahl von Komponenten des Spindelpolkörpers in Kontakt mit Mlp2. Ich charakterisierte diese Interaktion im Detail und identifizierte die Rolle, die Mlp2 bei der Spindelkörper-Assemblierung und -Erhaltung spielt. Diese Arbeit wurde in The Journal of Cell Biology veröffentlicht.

In einer zweiten Publikation habe ich die strukturelle Rolle von Mlp1 und Mlp2 an der Kernhülle weiter untersucht. Beide Proteine bilden zusammen den Korb des Kernporenkomplexes, wo sie wahrscheinlich ihren Einfluss auf die Qualitätskontrolle und den Export von mRNA ausüben. Außerdem binden sich die Mlps gegenseitig und bilden ein Proteinnetzwerk, das einen Großteil der Kernhülle umspannt. Dieses Proteinnetzwerk stabilisiert den Kern physikalisch und dient auch als Montageplattform für Komplexe an der Hülle, darunter Esc1p und das Proteasom.

Meine Kollegen und ich hatten die großartige Gelegenheit, vieles von dem, was wir in den letzten zehn Jahren über die Rolle des NPC und seiner peripheren assoziierten Strukturen für die Kernfunktion gelernt haben, in einem Review für Nature Reviews Molecular Cell Biology zusammenzufassen. Darin haben wir dargelegt, wie sich der Kernporenkomplex als ein wichtiger Regulator der Genexpression herauskristallisiert. Sowohl durch seinen Einfluss auf die Organisation des Zellkerns als auch durch seine offenbar weitreichende Beteiligung an der Koordination der Übergabe von mRNA an die zytoplasmatische Proteinsynthesemaschinerie.

Strambio-De-Castillia, Caterina, Mario Niepel, und Michael P Rout. „The nuclear pore complex: bridging nuclear transport and gene regulation“. Nature Reviews Molecular Cell Biology 11, no. 7 (2010): 490 – 501.

Niepel, Mario, Kelly R Molloy, Rosemary Williams, Julia C Farr, Anne C Meinema, Nicholas Vecchietti, Ileana M Cristea, Brian T Chait, Michael P Rout, and Caterina Strambio-De-Castillia. „Die Kernkorbproteine Mlp1p und Mlp2p sind Teil eines dynamischen Interaktoms, zu dem auch Esc1p und das Proteasom gehören.“ Molecular biology of the cell 24, no. 24 (2013): 3920 – 3938.

Niepel, Mario, Julia C Farr, Rosemary Williams, Anne C Meinema, Michael P Rout, and Caterina Strambio-De-Castillia. „Rapid isolation of functionally intact nuclei from the yeast Saccharomyces“ Molecular biology of the cell (under review)