Mario Niepel
Ik heb mijn Ph.D. werk gedaan in het laboratorium van Mike Rout aan The Rockefeller University. Ik werkte aan een fundamentele celbiologische en biochemische vraag: Wat is de rol van Mlp1 en Mlp2 in gist? Aanvankelijk streefde ik naar een fenotypische benadering, maar de reeks fenotypen door deletie van Mlp-eiwitten bleek te verwarrend om te interpreteren. In plaats daarvan optimaliseerde ik een biochemische benadering om natieve complexen uit gist te isoleren en de componenten met behulp van massaspec te analyseren.
In overeenstemming met eerdere bevindingen waren de dominante bindingspartners van Mlps componenten van het NPC en de mRNA-verwerkings- en transportmachinerie. Ik identificeerde echter ook een groot aantal componenten van het spindel pool lichaam in contact met Mlp2. Ik heb deze interactie in meer detail gekarakteriseerd en vastgesteld welke rol Mlp2 speelt in de assemblage en het onderhoud van het spindellichaam. Dit werk is gepubliceerd in The Journal of Cell Biology.
In een tweede publicatie heb ik de structurele rol van Mlp1 en Mlp2 bij de nucleaire envelop verder onderzocht. Beide eiwitten vormen samen de mand het nucleaire poriecomplex, waar zij waarschijnlijk hun invloed uitoefenen op de kwaliteitscontrole en export van mRNA. Bovendien binden de Mlp’s elkaar en vormen een eiwitnetwerk dat een groot deel van de nucleaire envelop omspant. Dit eiwitnetwerk stabiliseert de kern en dient ook als een platform voor de assemblage van complexen in het omhulsel, waaronder Esc1p en het proteasoom.
Mijn collega’s en ik kregen een geweldige kans om veel van wat we de afgelopen tien jaar hebben geleerd over de rol van het NPC en zijn perifeer geassocieerde structuren voor de nucleaire functie, samen te vatten in een review voor Nature Reviews Molecular Cell Biology. Daarin hebben we uiteengezet hoe het nucleaire poriecomplex zich ontpopt als een belangrijke regulator van genexpressie. Zowel door zijn invloed op de organisatie van de celkern als door zijn kennelijk uitgebreide betrokkenheid bij de coördinatie van de aflevering van mRNA aan de cytoplasmatische eiwitsynthese-machinerie.
Strambio-De-Castillia, Caterina, Mario Niepel, and Michael P Rout. “Het nucleaire poriecomplex: brug tussen nucleair transport en genregulatie.” Nature Reviews Molecular Cell Biology 11, no. 7 (2010): 490 – 501.
Niepel, Mario, Kelly R Molloy, Rosemary Williams, Julia C Farr, Anne C Meinema, Nicholas Vecchietti, Ileana M Cristea, Brian T Chait, Michael P Rout, and Caterina Strambio-De-Castillia. “De nucleaire basket-eiwitten Mlp1p en Mlp2p maken deel uit van een dynamisch interactoom met inbegrip van Esc1p en het proteasoom.” Moleculaire biologie van de cel 24, nr. 24 (2013): 3920 – 3938.
Niepel, Mario, Julia C Farr, Rosemary Williams, Anne C Meinema, Michael P Rout, en Caterina Strambio-De-Castillia. “Rapid isolation of functionally intact nuclei from the yeast Saccharomyces” Moleculaire biologie van de cel (in review)