Mario Niepel

Doktoryzowałem się w laboratorium Mike’a Routa na Uniwersytecie Rockefellera. Pracowałem nad podstawowymi zagadnieniami z zakresu biologii komórki i biochemii: Jaka jest rola Mlp1 i Mlp2 w drożdżach? Początkowo stosowałam podejście fenotypowe, ale szereg fenotypów powstałych w wyniku delecji białek Mlp okazał się zbyt skomplikowany do interpretacji. Zamiast tego zoptymalizowałam podejście biochemiczne, aby wyizolować natywne kompleksy z drożdży i przeanalizować ich składniki za pomocą spektroskopii masowej.

Zgodnie z wcześniejszymi ustaleniami, dominującymi partnerami wiążącymi białka Mlp były składniki NPC oraz mechanizmy przetwarzania i transportu mRNA. Jednakże zidentyfikowałam również dużą liczbę komponentów ciała wrzeciona kontaktujących się z Mlp2. Scharakteryzowałam te interakcje bardziej szczegółowo i zidentyfikowałam rolę, jaką Mlp2 odgrywa w tworzeniu i utrzymaniu ciała wrzeciona. Praca ta została opublikowana w The Journal of Cell Biology.

W drugiej publikacji zbadałam strukturalną rolę odgrywaną przez Mlp1 i Mlp2 w otoczce jądrowej. Oba białka razem tworzą koszyk kompleksu jądrowego, który prawdopodobnie jest miejscem, gdzie wywierają swój wpływ na kontrolę jakości mRNA i eksport. Ponadto, Mlpy wiążą się ze sobą i tworzą sieć białkową, która rozciąga się na większą część otoczki jądrowej. Ta sieć białek fizycznie stabilizuje jądro, a także służy jako platforma montażowa dla kompleksów w otoczce, w tym Esc1p i proteasomu.

Moi koledzy i ja mieliśmy wspaniałą okazję, aby podsumować wiele z tego, czego dowiedzieliśmy się w ciągu ostatniej dekady o roli NPC i jej peryferyjnie związanych strukturach dla funkcji jądrowych w przeglądzie dla Nature Reviews Molecular Cell Biology. Przedstawiliśmy w nim, w jaki sposób kompleks porów jądrowych staje się ważnym regulatorem ekspresji genów. Zarówno poprzez jego wpływ na organizację jądra, jak i poprzez jego najwyraźniej szerokie zaangażowanie w koordynację dostarczania mRNA do cytoplazmatycznej maszynerii syntezy białek.

Strambio-De-Castillia, Caterina, Mario Niepel, and Michael P Rout. „The nuclear pore complex: bridging nuclear transport and gene regulation.” Nature Reviews Molecular Cell Biology 11, no. 7 (2010): 490 – 501.

Niepel, Mario, Kelly R Molloy, Rosemary Williams, Julia C Farr, Anne C Meinema, Nicholas Vecchietti, Ileana M Cristea, Brian T Chait, Michael P Rout, and Caterina Strambio-De-Castillia. „Jądrowe białka koszykowe Mlp1p i Mlp2p są częścią dynamicznego interakcjomu obejmującego Esc1p i proteasom.” Molecular biology of the cell 24, no. 24 (2013): 3920 – 3938.

Niepel, Mario, Julia C Farr, Rosemary Williams, Anne C Meinema, Michael P Rout, and Caterina Strambio-De-Castillia. „Rapid isolation of functionally intact nuclei from the yeast Saccharomyces” Molecular biology of the cell (w recenzji)